L’article analyse le développement des relations entre universités et territoires dans l’agglomération lyonnaise. En adoptant une perspective historique (1958-2009), il montre que l’intensification des relations entre universités et territoires prend sens au carrefour de logiques internationales, nationales et locales. Le renouvellement des exécutifs locaux et académiques, l’internationalisation de la concurrence universitaire et urbaine, les recompositions de la gestion publique territoriale et des politiques universitaires incitent universitaires et élus locaux à renforcer leur coopération. L’article montre ensuite que les coopérations académiques et territoriales sont aussi marquées par des évolutions progressives dans leur contenu. En s’institutionnalisant au fil du temps, ces collaborations se redéfinissent partiellement pour donner de nouveaux visages aux liens entre universités et territoires.